Управљачки систем је основна компонента вертикалног обрадног центра. Прима команде оператера и контролише кретање различитих компоненти машине. Контролни системи обично користе високо{2}}прецизне ЦНЦ системе, омогућавајући сложене путање обраде и прецизно позиционирање. Кроз прецизну контролу контролног система, вертикални обрадни центри могу постићи високу{4}}прецизну обраду, значајно побољшавајући ефикасност и квалитет производње.
